Uno de los éxitos más grandes que consiguió la selección durante esta década fue el Mundial de 2006 disputado en Saitama, Japón. En este torneo, España logró por primera vez ser Campeona del Mundo de baloncesto tras vencer a Grecia en una dura final. Los de Pepu Hernández supusieron un antes y un después para la historia del baloncesto en el país.

Hace cerca de veinte años que el conjunto nacional de entonces viajaba hasta el país asiático para disputar por primera vez un campeonato de estas características. El camino para lograr el oro no fue fácil, no solo por el esfuerzo ejercido por los jugadores y cuerpo técnico de cada una de las etapas previas, sino también por como se desarrolló este torneo, marcado por lesiones de gravedad en jugadores clave y otras circunstancias vitales.

Los españoles lograron nueve victorias en nueve partidos jugando un baloncesto de calidad y propio del máximo nivel. Comenzó superando a Nueva Zelanda (86-70), Panamá (101-57), Alemania (92-71), Angola (93-83), Japón (104 - 55) y Serbia & Montenegro (87-75). En cuartos de final venció a Lituania (89-67), en semifinales a Argentina (75-74) y en la final a una Grecia (70-47) que había eliminado en semifinales a Estados Unidos, en el que ya jugaban figuras esenciales de este deporte y de la NBA como LeBron James, Carmelo Anthony o Chris Paul, entre otros. 

En la semifinal frente a Argentina comenzaron a surgir los obstáculos a los que tuvo que hacer frente el equipo. Con un marcador apretado durante todo el partido, los tiros libres acertados de Pau Gasol en los últimos segundos y un tiro de tres errado de Nocioni sobre la bocina fueron los factores que condicionaron el resultado del encuentro. A pesar de que parecía, que pese al esfuerzo y la tensión, todo había salido bien la realidad era que tendrían que hacer frente a la lesión de un jugador clave con el que no podrían contar para la final, Pau Gasol, que terminó derrumbado en el suelo con una grave lesión.